En 1895, después que se terminó el edificio de la iglesia, ella publicó el Manual de la Iglesia de La Primera Iglesia de Cristo, Científico, estableciendo reglas sobre el gobierno y normas de conducta para los miembros de su iglesia. Ella continuó revisando y actualizando el Manual como lo requerían los acontecimientos. La versión final y definitiva del Manual de la Iglesia fue aprobada por la Sra. Eddy y publicada como la 89na edición, el 17 de diciembre de 1910.
Manual of The Mother Church, 1st edition; 89th edition